ვიდეო: რა არის BAM ინდექსის ფაილი?
2024 ავტორი: Lynn Donovan | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2023-12-15 23:49
ა BAM ფაილი (. ბამ ) არის SAM-ის ორობითი ვერსია ფაილი . SAM ფაილი (. sam) არის ჩანართებით გამოყოფილი ტექსტი ფაილი რომელიც შეიცავს თანმიმდევრობის გასწორების მონაცემებს. ინდექსირება : IGV მოითხოვს, რომ SAM და BAM ფაილები დალაგდეს პოზიციის მიხედვით და ინდექსირებული და რომ ინდექსის ფაილები დაიცავით კონკრეტული სახელების კონვენცია.
ანალოგიურად, ხალხი იკითხავს, როგორ გავხსნა BAM ფაილი?
Დან ფაილი მენიუს არჩევა გახსენით და აირჩიეთ BAM ფაილები მარცხენა მხრიდან. აირჩიეთ ღილაკი მარჯვნივ, რომელიც ამბობს Add a BAM ფაილი . ნავიგაცია BAM ტესტი ფაილები თქვენ მიერ გადმოწერილი საქაღალდე აირჩიეთ with_index_with_graph. დააწკაპუნეთ გახსენით აირჩიეთ რუკა.
მეორეც, როგორ გადავიყვანო BAM ფაილი Fastq-ად? ქვემოთ მოცემულია ნაბიჯები BAM ფაილის FASTQ ფორმატში გადასაყვანად. ეს იმუშავებს Linux-ზე და დასჭირდება SAMTOOLS და BEDTOOLS
- ჩამოტვირთეთ SAMTOOLS.
- ამონაწერი Command tar xzvf samtools-version.tar.bz2 გამოყენებით.
- ის შექმნის საქაღალდეს სახელწოდებით samtools-version.
- გადადით დირექტორიაში cd samtools-version.
ანალოგიურად, როგორ გადავიყვანო BAM ფაილი SAM ფაილად?
რომ გადაიყვანეთ SAM რომ BAM , ვიყენებთ samtools view ბრძანებას. ჩვენ უნდა დავაზუსტოთ, რომ ჩვენი შეყვანა არის SAM ფორმატი (ნაგულისხმევად მოელის BAM ) -S ოფციის გამოყენებით. ისიც უნდა ვთქვათ, რომ ჩვენ გვინდა გამომავალი იყოს BAM (ნაგულისხმევად ის აწარმოებს BAM ) -b ვარიანტით.
რას აკეთებს Samtools view?
სამტულები არის კომუნალური საშუალებების ერთობლიობა, რომელიც მანიპულირებს გასწორებები BAM ფორმატში. ის ახდენს იმპორტს და ექსპორტს SAM (Sequence Alignment/Map) ფორმატში, აკეთებს დახარისხება, შერწყმა და ინდექსირება და საშუალებას გაძლევთ სწრაფად მიიღოთ წაკითხვები ნებისმიერ რეგიონში. სამტულები შექმნილია ნაკადზე მუშაობისთვის.
გირჩევთ:
არის თუ არა TIFF ფაილი ვექტორული ფაილი?
TIF – (ან TIFF) ნიშნავს Tagged Image File Format და არის დიდი რასტრული ფაილი. TIF ფაილი ძირითადად გამოიყენება გამოსახულების დასაბეჭდად, რადგან ფაილი არ კარგავს ინფორმაციას ან ხარისხს, როგორც ამას JPEG. ეს არის ვექტორზე დაფუძნებული ფაილი, რომელიც შეიძლება შეიცავდეს ტექსტს, ასევე გრაფიკას და ილუსტრაციებს
რა არის ინდექსის სწრაფი სრული სკანირება?
სრული ინდექსის სწრაფი სკანირება არის სრული ცხრილის სკანირების ალტერნატივა, როდესაც ინდექსი შეიცავს ყველა სვეტს, რომელიც საჭიროა მოთხოვნისთვის და მინიმუმ ერთ სვეტში. ინდექსის გასაღებს აქვს NOT NULL შეზღუდვა. სწრაფი სრული სკანირება წვდება მონაცემებს თავად ინდექსში, ცხრილზე წვდომის გარეშე
რა არის უსაფრთხოების კლასიფიკაციის სახელმძღვანელოების DoD ინდექსის მიზანი?
მისი მიზანია დაეხმაროს უსაფრთხოების კლასიფიკაციის სახელმძღვანელოს შემუშავებაში, რომელიც საჭიროა DoD 5200-ის 2-500 პუნქტით. 1-R, თითოეული სისტემის, გეგმის, პროგრამის ან პროექტისთვის, რომელშიც ჩართულია საიდუმლო ინფორმაცია
რა არის ტრანზაქციის ფაილი და მასტერ ფაილი?
განმარტება: ტრანზაქციის ფაილი. ტრანზაქციის ფაილი. ტრანზაქციის ჩანაწერების კოლექცია. მონაცემთა ინტერაქციის ფაილები გამოიყენება ძირითადი ფაილების განახლებისთვის, რომლებიც შეიცავს მონაცემებს ორგანიზაციის სუბიექტების შესახებ (მომხმარებლები, თანამშრომლები, გამყიდველები და ა.შ.)
რა არის სვეტის ინდექსის ნომერი Vlookup-ისთვის?
პოლკოვნიკის ინდექსი ნომრ. Lookup Value ყოველთვის არის ცხრილის მასივის ყველაზე მარცხენა სვეტში (სვეტი #1, მიუხედავად იმისა, თუ სად მდებარეობს ცხრილი სამუშაო ფურცელში). შემდეგი სვეტი მარჯვნივ არის სვეტი #2, შემდეგ სვეტი #3 და ა.შ. Col index num უბრალოდ არის სვეტის ნომერი, რომელიც შეიცავს მნიშვნელობას, რომლის მიღებაც გსურთ